運行參數設定對精度的影響同樣顯著。溫變速率設定需與設備實際能力匹配，若強行將速率設定超出設備負載（如要求 15℃/min 而設備額定速率為 10℃/min），會造成壓縮機頻繁啟停、加熱器持續滿負荷工作，不僅導致溫度波動增大，還會縮短設備使用壽命。同時，溫度傳感器的安裝位置偏差會直接影響數據采集精度，若傳感器靠近加熱器或風道出口，采集的溫度值會高于實際樣品區域溫度，形成 “假陽性" 數據。